
Здание собора построено в 1633–1642 годах в качестве главного храма католического женского монастыря бернардинок.
В 1852 году католический монастырь был закрыт, а в 1860 году храм объявили православным и
назвали в честь Мефодия и Кирилла. via

То есть православная церковь прихватизировала храм у католической, но не решилась продолжать дело женского монастырства, а оставила храм как храм. Но, как и теперь часто случается, заменила название общественного места, дабы прославить и Кирилла, и Мефодия, а не напоминать народу зазря о прежних героях.